Alexandre Réjaud

Equipe : DEEP
Catégorie : Doctorat
Téléphone : 05 61 55 67 56
Pièce: 33
Descriptif :

Recherche  Ma recherche a pour but d’améliorer la compréhension de la mise en place de la diversité actuelle. Pour ce faire, j’utilise des approches de modélisation en évolution, principalement les méthodes phylogénétiques et les méthodes comparatives. Le but de mon projet de thèse est d’améliorer la compréhension du patron de diversification et de biogéographie historique des amphibiens amazoniens. Dans un premier temps, je cherche à estimer l’histoire biogéographique et la diversification au cours du temps de plusieurs groupes d’espèces. Dans ce but, j’applique pour chaque groupe un pipeline méthodologique en quatre étapes : (i) Toutes les séquences de 16S disponibles pour le groupe cible sont utilisées dans une étape de délimitation moléculaire afin obtenir des limites claires entre les lignées évolutives ainsi que des cartes de distribution fiables; (ii) Les séquences de 16S possèdent un faible signal phylogénétique. Par conséquent, la deuxième étape consiste à séquencer des mitogénomes complets pour un maximum de lignées évolutives identifiées lors de l’étape de délimitation moléculaire; (iii) Ces données mitogénomiques sont ensuite utilisées dans l’étape de reconstruction phylogénétique calibrée dans le temps, afin d’obtenir une estimation des relations phylogénétiques et des dates de divergences entre lignées évolutives; (iv) La dernière étape consiste à appliquer deux types de modèles sur la phylogénie calibrée dans le temps. D’une part, j’utilise une approche de reconstruction d’aires ancestrales afin de reconstruire l’histoire biogéographique du groupe cible. D’autre part, j’applique des modèles de diversification au cours du temps. Dans un deuxième temps, je réaliserai une analyse comparative de l’histoire biogéographique et de la dynamique de diversification au cours du temps de ces différents groupes d’espèces d’amphibiens amazoniens. Formation  Master BEE – Parcours EE à l’Université Toulouse III Paul Sabatier