Géraldine Loot

Equipe : AQUAECO
Catégorie : PR UPS
Téléphone : 05 61 55 64 74
Pièce: 24
Descriptif :

Recherche  Ma thématique de recherche vise à mieux comprendre la dynamique écologique et évolutive des interactions hôte-parasite et leur rôle dans la structuration et le fonctionnement des écosystèmes dans le contexte des changements globaux.Actuellement j’étudie un pathogène invasif (PKD) qui infecte la truite fario. Ce projet a pour objectifs 1/ de mettre au point une méthode de détection non-létale du pathogène (ADNe) afin d’étudier sa distribution spatiale à large échelle, 2/ de déterminer les facteurs environnementaux liés à la prévalence de cette épidémie et 3/ d’étudier l’histoire évolutive de ce parasite et sa structuration génétique (mise au point de SNP). Par ailleurs, je m’intéresse aux liens de causalité entre le microbiome de nageoires de vandoises et l’ectoparasite Tracheliastes polycolpus qui se fixe sur les nageoires. Il s’agit à l’aide d’une expérimentation en milieu naturel (caging dans la rivière) de comparer le microbiome avant et après infection par le parasite et de déterminer 1/ si la communauté bactérienne présente chez certains individus poissons (certaines nageoires) favorise t’elle l’installation de T. polycolpus ou 2/ si la présence du parasite sur les nageoires modifie l’abondance relative et la diversité des communauté bactérienne. Responsabilité  J’ai la coresponsabilité du M1 BEE Biodiversité, Écologie & Évolution (2016-2021) (2022-2027). Je copilote avec Lisa Jacquin (EDB) et Simon Blanchet (SETE) un programme de recherche AFB sur le pathogène invasif PKD qui infecte la truite fario (PKD project). Je copilote avec Olivier Rey (IHPE) et Eve Toulza (IHPE) un projet Tulip sur les liens de causalité entre la composition du microbiome de nageoires de vandoises et la présence d’un ectoparasite Tracheliastes polycolpus (HOST-PARASITE-MICROBIOME). Je copilote avec Julien Cucherousset (EDB) un projet AGEAU sur l’étude des espèces exotiques envahissantes du réseau hydrographique de la Garonne (DISPERINVA). Formation  Doctorat en 1999 à l’Université Toulouse III; HDR en 2008 à l’Université Toulouse III Paul Sabatier; Lauréate membre junior de l’Institut Universitaire de France (IUF) 2016-2021