Lengguru : une centaine de candidats au statut d’espèce
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Christophe Thébaud, Antoine Fouquet

Une récente étude menée par l’UMR ISEM et ses nombreux partenaires décrit les résultats d’un inventaire des espèces de vertébrés du massif karstique de Lengguru, en Papouasie indonésienne. Sur les 264 espèces caractérisées à l’aide de code-barres ADN, plus de 100 correspondent à des organismes encore non décrits ou à des lignées morphologiquement indiscernables.

Alors que nous observons à l’échelle planétaire une érosion croissante de la biodiversité et l'extinction de nombreuses espèces, des chercheurs découvrent cependant de nouvelles espèces, particulièrement en Nouvelle Guinée. Tour d’horizon du massif de Lengguru où l'inventaire des espèces est loin d'être complet.

De par ses paysages accidentés et inaccessibles, l’intérieur de l’île reste encore largement inexploré. Elle a été protégée de la déforestation jusqu’à la fin du XX^è siècle mais l’intensification de l’agriculture et le développement d’infrastructures au début du XXI^è siècle constituent maintenant des menaces potentielles pour cette biodiversité si singulière.

« Elle est co-signée par 41 co-auteurs appartenant à 7 structures de recherche indonésiennes, 4 UMR et USR françaises, le centre de génomique de la biodiversité de l’université de Guelph au Canada et le muséum d’histoire naturelle de Madrid », précise Nicolas Hubert, l'auteure principale de l'étude.

Des code-barres ADN identifient de nouveaux organismes

Ainsi multidisciplinaire, cette expédition a été l’occasion de conduire cet inventaire par code-barres ADN, technologie utilisant une séquence standard de 650 paires de base d'un gène?. « Cette approche a obtenu une validation populaire considérable, pour ses résultats rapides, et s'avère être un outil particulièrement utile pour la caractérisation précoce d'espèces moins étudiées », précise Gonio Semiadi, mammalogiste et professeur aux collections nationales indonésiennes. Basée sur une librairie d’un millier de code-barres ADN et des approches génétiques de délimitation d’espèce, cette étude révèle l’étendue du déficit de connaissances de la faune du massif de Lengguru.

« Manquant de ressources et de temps pour identifier la vaste biodiversité de l'Indonésie, cette étude montre que l’approche des code-barres ADN nous permet de gagner un temps précieux » affirme Evy Arida, herpétologiste aux collections nationales et première auteure de l’étude. « Sur les 264 unités délimitées, candidates au statut d’espèce, de mammifères, oiseaux, reptiles, amphibiens et poissons, 75 correspondent à des organismes encore non décrits et 48 à des lignées morphologiquement indiscernables », ajoute Nicolas Hubert. De manière tout à fait surprenante pour une faune tropicale, la plupart de ces lignées ont émergé récemment, au cours du Pléistocène à de petites échelles spatiales. Cette étude, en posant les bases d’un inventaire standardisé des biotas de Papouasie, ouvre de nouvelles perspectives autour de la gestion durable de ces ressources.